一、重點科目
▍ 普通生物學（實驗）
生物學研究生命的所有面向，包括生命起源、進化、構造、發育、功能、行為與環境的互動關係等。海洋科學相關學系研究生物學主要是為了針對生活在海洋中的生物進行研究打下基礎。
▍ 海洋資源導論
海洋的資源是人類及許多生物維繫生命的重要來源。台灣四面環海，海洋中包含各類生物及非生物資源，生物資源方面包括海洋中的浮游生物資源、微生物資源及魚類資源，以及某些具有特殊藥物用之生物資源開發利用等；非生物資源包括海水資源、海洋中的礦物及物理化學資源等。
▍ 有機化學
有機化學是研究有機化合物的結構、性質的學科，也是生物化學的基礎。本課程主要是幫助同學建立有機化學的基本概念，首先要熟悉各類有機化合物的命名、結構、物理及化學性質，例如，烷類、烯類、炔類、芳香烴、鹵烷類、醇類、醚類、酚類、醛酮類、胺類等。另一方面，瞭解相關有機化學反應之理論基礎，也能讓同學具備簡單化合物之合成及官能基互相轉換之基本概念。在現實世界中，要找出一個純無機的環境非常困難，例如土壤中存在大量的有機物質，比如胺基酸、腐植質之類。有機合成材料品種很多，塑料、合成纖維、合成橡膠就是通常所指稱的三大合成材料。
▍ 海洋化學
海洋化學是研究海洋中各種物質的化學組成與分佈，這些物質的化學性質和化學過程，以及海洋化學資源的開發利用的科學，是海洋科學的一個分支，和海洋生物學、海洋地質學、海洋物理學等有密切的關係。最早的海洋化學的應用就是鹽的生產，現代海洋化學主要在研究海洋環境中化學物質的分佈、轉移、迴圈的規律及其在開發利用中的化學問題。海水的成分非常複雜，除了鹽以外，海水中還含有大量非常稀有的元素，是地球上最大的礦產資源庫。海洋資源的持續利用是人類生存發展的重要前提，這些都是海洋化學所要研究的方向。
▍ 海洋物理學
海洋物理學主要是以物理學的理論、技術和方法，研究海洋內部及鄰近大氣的各種物理性質，以及牽涉海洋所發生的各種物理現象，例如海洋水體與大氣圈、岩圈和生物圈的相互作用。研究主題包括了海流、潮汐、波浪、海水循環、海水與海底沉積物的物理性質，海水與大氣間的關係等，一些研究主題也與氣象學關係密切。
▍ 地球科學概論
地球科學概論是針對地球科學的四大領域：大氣、太空、地球（質）、海洋進行概括性的介紹，使海洋科學相關學系的學生能對於地球科學的其他領域有所認識，進而得以進行跨科的學習與交流。
▍ 海洋氣象學
海洋氣象學是研究海上大氣的物理現象，以及海洋與大氣相互作用規律的一門科學，是海洋學與大氣科學的交會。由於地球表面的絕大部分為海洋所覆蓋，而海水又具有和陸地迥然不同的物理、化學性質，使得海洋氣象學研究與陸地相比有所差異。也重視研究大氣環流和海洋環流的生成及其影響，例如聖嬰效應的研究即是一例。
▍ 環境科學導論
環境科學包含了影響人類和其他有機體周邊環境的學科，因此是一個跨學科領域的專業，既包含像物理、化學、生物、地質學、地理、資源技術和工程等的自然科學，也有像資源管理和保護、人口統計學、經濟學、政治和倫理學等社會科學。環境科學是隨著環境議題被重視而逐步發展，在總體角度，環境科學研究人與環境之間的互動關係；從個體角度，環境科學研究環境中的物質在有機體內遷移、轉化、蓄積的過程與運動規律，及這些物質對生命的影響和作用，尤其是人類活動排放出來的污染物質。
▍ 海洋觀測（實作）
本課程是為了培養學生觀察海洋現象的能力而開設的，使學生能了解海洋研究基本觀測方法，瞭解跨領域海洋研究的時間及空間尺度差異，並能有效運用海洋調查策略。
▍ 海洋生物學
海洋生物學是海洋科學的一個主要學科，也是生命科學的一個重要分支，是研究在海洋生存空間中棲息的生物及其生活歷程的科學，主要研究內容包括海洋有機體的功能，海洋生物多樣性以及海洋生態三個方面。在新聞中，常可見到海洋探險隊深入深海進行生物攝影或探勘，即是屬於海洋生物學的研究行動，此外漁業也提供了相關科學研究的素材，研究探索海洋中生命有機體的起源與分佈、形態和結構、進化與演替的特徵以及生物生命過程的活動規律，並探索海洋生物之間和生物與其所處的海洋環境之間的相互作用和相互影響，並能利用這些發現為人類近一步的提供幫助。
二、未來出路
1.地科所、海洋所、地質所、大氣所、地理所、天文所
2.環境所、環工所、物理所、統計所、生物所、水產所、休閒觀光所
3.高普考
4.地方特考
5.教師證照、海洋相關證照（動力小船駕駛執照、潛水執照、導遊領隊證照）
6.中油、台電、台水、台糖
7.工程地質師、土壤地下水工程師、礦物工程師
